微生物測序

使用一代測序技能,對微的微生物染色體遺傳組實施裝配,染色體遺傳職能發掘,疾病群落組建簽定,辨析群落空間結構、體系提升等
細菌完成圖
mtk量測序新高技術的高速 成長 提速了對微生物學學表觀遺傳組的科學研究,第三代測序新高技術早已經還可以緩解螨蟲表觀遺傳組中再次回文序列長、極端主義 GC 硫含量位置沒有逾越等按裝瓶頸,按裝出十分完整篇的螨蟲“結束圖”。
真菌精細圖
念珠菌表觀遺傳組基本在10M-150M,有多核和雜合等現像,通過三代試管測序枝術的資源優勢破譯念珠菌表觀遺傳組,有全表觀遺傳組隊列圖譜,導致通過職能表觀遺傳組開挖。
全長16S擴增子測序
16S rRNA表觀遺傳是病毒職業的分子結構標記圖片。可以通過第三代測序技木對16s rRNA表觀遺傳特殊區城進行PCR擴增和測序,探析生態中病毒的形成、相豐度。
文章案例
如何快速砂生態學脫水池中的群落型式

全長16S測序揭示飲用水系統中錳氧化微生物對不同生物濾池濾料的響應

  很快砂微微動物濾池(RSBF)被密切用作除去喝水處理設備中的環境污染破壞物。微微動物濾池中的微微動物膜微微微動物群落結構類型在環境污染破壞物的微微動物圖片轉換中表現側重要的作用。該研發合理利用PacBio起點終點16S增加子測序橫向對強力強磁鐵礦砂濾水池(MagSeRSBF)(40d、80d、120d,9個子樣表量)和錳砂濾水池(MnSeRSBF)(40d、80d、120d,9個子樣表量)中真菌群落做好研發,均勻各個子樣表量獲取6058-11350條CCS,354-573個OTU。研發知道,形變菌門為整個子樣表量優劣勢菌門,假單胞菌屬、擬桿菌屬和絲狀菌為優劣勢菌屬,且與假定的錳脫色真菌光于。種橫向研發知道維氏假胞菌幾率極具錳脫色的能力素質。MnSeRSBF的動物群互作無線網絡比MagSeRSBF更非常復雜。強力強磁鐵礦砂和錳砂的混和微微動物濾池幾率是很快砂濾水錳脫色的有效性使用。
參考資料專著:Zhao Xin, Liu Bingfeng, Wang Xiuheng et al. Single molecule sequencing reveals response of manganese-oxidizing microbiome to different biofilter media in drinking water systems. [J]. Water Res, 2020,171: 115424.
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